不会，亲子鉴定不会不会被搞混。鉴定机构有严格的规范与一整套科学的流程，保障亲子鉴定样本不会被搞混。

亲子鉴定样本会被搞混吗

个人亲子鉴定按要求操作样本就不会被搞混

鉴定机构会对样本的采集、标记、保存提交等有一系列的规范与要求，用户只需要按照要求操作即可，而且用户主观意愿上不会故意将样本搞混，只要保证样本是需要鉴定的对象的即可，那么鉴定结果就不会有错。

司法亲子鉴定由司法程序保障样本不会被搞混

司法亲子鉴定严格按司法程序鉴定，所有鉴定对象到现场由法医采集，且需要对身份进行识别、实名登记鉴定，不但保障样本样本不会被搞混，还要保障样本对应的鉴定对象的身份真实等。

友情说明

鉴定机构及参与鉴定的法医和工作人员实行责任制，必须对样本对应的鉴定结果的准确性负责，样本是不会被搞混的。